巴里坤镇于1950年建置为区域人民政府,1956年撤区,改建为城镇人民政府;1961年改建为城镇人民公社,辖1个农业生产大队,1个牧场,3个居委会。1975年农业大队和牧场划归花园,建置为巴里坤镇至今。